tokens
listlengths
1
168
tags
listlengths
1
168
[ "Figure", "was", "created", "in", "R", "3.6.3", "(", "The", "R", "Project", "for", "Statistical", "Computing", ";", "https://www.r-project.org/packages", ":", "corrplot", ",", "Hmisc", ",", "RColorBrewer", ",", "Cairo", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pearson", "’s", "correlation", "of", "lipid", "classes", "concentrations", "and", "clinical", "parameters", ".", "(" ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "I-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "for", "rosuvastatin", "treatment", "at", "D1", "(", "G1", ")", ",", "(", "b", ")", "for", "simvastatin", "plus", "ezetimibe", "treatment", "at", "D1", "(", "G3", ")", ",", "(", "c", ")", "for", "rosuvastatin", "treatment", "(", "G2", ")", "at", "D30", ",", "and", "(", "d", ")", "for", "simvastatin", "plus", "ezetimibe", "treatment", "at", "D30", "(", "G4", ")", "." ]
[ "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Figure", "was", "created", "in", "R", "3.6.3", "(", "The", "R", "Project", "for", "Statistical", "Computing", ";", "https://www.r-project.org/packages", ":", "corrplot", ",", "Hmisc", ",", "RColorBrewer", ",", "Cairo", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "OPLS-DA", "scores", "plot", "(", "Fig.", "4", ")", "shows", "a", "separation", "among", "the", "four", "studied", "groups", "(", "G1", ",", "G2", ",", "G3", "and", "G4", ")", "." ]
[ "O", "B-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "possible", "to", "observe", "a", "higher", "separation", "between", "time", "of", "treatment", ",", "D1", "(", "G1", "and", "G3", ")", "and", "D30", "(", "G2", "and", "G4", ")", ",", "in", "comparison", "to", "the", "separation", "between", "the", "two", "lipid-lowering", "therapies", ",", "rosuvastatin", "(", "G1", "and", "G2", ")", "and", "simvastatin", "plus", "ezetimibe", "(", "G3", "and", "G4", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "a", "worst", "separation", "was", "observed", "between", "the", "two", "lipid-lowering", "therapies", "at", "D30", "(", "G2", "×", "G4", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "OPLS-DA", "model", ",", "with", "R", "=", "0.637", "and", "Q", "=", "0.246", ",", "was", "validated", "by", "CV-ANOVA", "(", "p-value", "=", "0.032", ")", "and", "permutation", "test", "(", "100", "permutations", ")", "of", "selected", "Y", "variables", "." ]
[ "O", "B-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "poor", "predictability", "of", "the", "model", ",", "indicated", "by", "Q", "<", "0.5", ",", "is", "provided", "by", "the", "low", "numbers", "of", "observations", "(", "n", "=", "10", ")", "and", "the", "properties", "of", "the", "dataset", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "this", "model", "must", "be", "validated", "by", "permutation", "test", "and", "by", "cross-validation", "(", "pcv-ANOVA", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "O", "O" ]
[ "The", "QVY", "values", "for", "each", "y", "variables", ",", "from", "the", "permutation", "test", ",", "had", "shown", "that", "the", "Y", "variable", "G4", "was", "responsible", "for", "the", "poor", "predictability", "of", "this", "model", "(", "Q", "=", "0.246", ")", "as", "shown", "in", "the", "Supplementary", "Table", "S1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Triba", "et", "al.", ",", "recommend", "to", "permute", "the", "lines", "of", "their", "dataset", "to", "control", "that", "the", "Q", "value", "calculated", "is", "stable", "regarding", "this", "permutation", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "the", "stable", "Q", "with", "low", "error", "(", "0.251", "±", "0.06", ";", "Q2", "mean", "±", "2*Error", ";", "Error", "=", "ta2*sd/√n", ")", "obtained", "towards", "a", "permutation", "test", "with", "five", "randomized", "dataset", ",", "indicating", "that", "the", "model", "is", "trustful", "(", "See", "Supplementary", "Table", "S2).Figure", "4OPLS-DA", "scores", "plot", "(", "PC1", "vs", "PC2", ")", "of", "all", "infarcted", "patients", "in", "the", "four", "groups", "considered", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "G1", ":", "Patients", "randomized", "to", "the", "rosuvastatin", "group", "at", "first", "day", "after", "myocardial", "infarction", "(", "D1", ")", ";", "G2", ":", "Patients", "treated", "by", "rosuvastatin", "after", "30", "days", "of", "treatment", "(", "D30", ")", ";", "G3", ":", "Patients", "randomized", "to", "the", "simvastatin", "plus", "ezetimibe", "group", "at", "the", "first", "day", "after", "myocardial", "infarction", "(", "D1", ")", ";", "G4", ":", "Patients", "treated", "by", "simvastatin", "plus", "ezetimibe", "after", "30", "days", "(", "D30", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Disease", "I-Disease", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Disease", "I-Disease", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Figure", "was", "created", "in", "SIMCA", "16", "(", "Statistical", "Software", "Package", ",", "Umetrics", ",", "Sweden", ";", "URL", ":", "http://umetrics.com/product/simca", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "OPLS-DA", "scores", "plot", "(", "PC1", "vs", "PC2", ")", "of", "all", "infarcted", "patients", "in", "the", "four", "groups", "considered", "." ]
[ "B-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "G1", ":", "Patients", "randomized", "to", "the", "rosuvastatin", "group", "at", "first", "day", "after", "myocardial", "infarction", "(", "D1", ")", ";", "G2", ":", "Patients", "treated", "by", "rosuvastatin", "after", "30", "days", "of", "treatment", "(", "D30", ")", ";", "G3", ":", "Patients", "randomized", "to", "the", "simvastatin", "plus", "ezetimibe", "group", "at", "the", "first", "day", "after", "myocardial", "infarction", "(", "D1", ")", ";", "G4", ":", "Patients", "treated", "by", "simvastatin", "plus", "ezetimibe", "after", "30", "days", "(", "D30", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Disease", "I-Disease", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Disease", "I-Disease", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Figure", "was", "created", "in", "SIMCA", "16", "(", "Statistical", "Software", "Package", ",", "Umetrics", ",", "Sweden", ";", "URL", ":", "http://umetrics.com/product/simca", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Discriminant", "variables", "were", "selected", "by", "the", "combination", "of", "multivariate", "analysis", "(", "VIP", ">", "1", ")", ",", "and", "univariate", "evaluation", "by", "post", "hoc", "test", "with", "Bonferroni", "correction", "for", "multiple", "comparisons", "of", "the", "repeated", "measures", "ANOVA", "(", "q-value", "<", "0.05", "for", "one", "of", "the", "comparisons", ")", "as", "shown", "in", "Supplementary", "Table", "S3", "and", "displayed", "in", "Fig.", "5", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "I-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "VIP", "value", "for", "all", "variables", "studied", "and", ",", "post-hoc", "(", "q-value", ")", "for", "variables", "considered", "statistically", "significant", "are", "shown", "in", "Supplementary", "Table", "S4", "and", "S5", ",", "respectively", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Figure", "5Discriminant", "lipids", "from", "multivariate", "(", "VIP", ">", "1", ")", "and", "univariate", "analysis", "(", "repeated", "measures", "ANOVA", ")", ".", "(" ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "I-Assay Type", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "O", "O", "O" ]
[ "%", "change", "of", "metabolites", "considering", "the", "temporal", "treatment", "effect", "(", "*", "metabolite", "statistically", "significant", "are", "highlighted", "with", "black", "borders", ")", ";", "(", "b", ")", "%", "of", "change", "of", "metabolites", "considering", "the", "lipid-lowering", "therapy", "effect", "(", "*", "metabolite", "statistically", "significant", "are", "highlighted", "with", "black", "border", ")", ";", "(", "c", ")", "Venn", "Diagram", "considering", "lipid-lowering", "therapy", ";", "(", "d", ")", "Venn", "Diagram", "considering", "temporal", "treatment", "effect", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Figure", "was", "created", "in", "Microsoft", "Excel", "2013", "(", "URL", ":", "https://www.microsoft.com/pt-br/microsoft-excel-2013", ")", "and", "Microsoft", "PowerPoint", "2013", "(", "URL", ":", "https://www.microsoft.com/pt-br/microsoft-powerpoint-2013", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Discriminant", "lipids", "from", "multivariate", "(", "VIP", ">", "1", ")", "and", "univariate", "analysis", "(", "repeated", "measures", "ANOVA", ")", ".", "(" ]
[ "O", "O", "O", "B-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "I-Assay Type", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "O", "O", "O" ]
[ "%", "change", "of", "metabolites", "considering", "the", "temporal", "treatment", "effect", "(", "*", "metabolite", "statistically", "significant", "are", "highlighted", "with", "black", "borders", ")", ";", "(", "b", ")", "%", "of", "change", "of", "metabolites", "considering", "the", "lipid-lowering", "therapy", "effect", "(", "*", "metabolite", "statistically", "significant", "are", "highlighted", "with", "black", "border", ")", ";", "(", "c", ")", "Venn", "Diagram", "considering", "lipid-lowering", "therapy", ";", "(", "d", ")", "Venn", "Diagram", "considering", "temporal", "treatment", "effect", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Figure", "was", "created", "in", "Microsoft", "Excel", "2013", "(", "URL", ":", "https://www.microsoft.com/pt-br/microsoft-excel-2013", ")", "and", "Microsoft", "PowerPoint", "2013", "(", "URL", ":", "https://www.microsoft.com/pt-br/microsoft-powerpoint-2013", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Figure", "5a", ",", "b", "show", "the", "percentage", "change", "related", "to", "the", "two", "lipid-lowering", "therapy", "effect", "(", "G1", "vs", "G3", "and", "G2", "vs", "G4", ")", "and", "temporal", "treatment", "effect", "(", "G1", "vs", "G2", "and", "G3", "vs", "G4", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "expected", ",", "fewer", "metabolites", "are", "altered", "related", "to", "the", "two", "lipid-lowering", "therapy", "comparison", "than", "temporal", "treatment", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Figure", "5c", "shows", "that", "2", "FA", ",", "4", "PC", "and", "2", "SM", "were", "significantly", "altered", "between", "the", "two", "lipid-lowering", "therapies", "at", "D1", "(", "G1", "vs", "G3", ")", ",", "only", "2", "LPC", "at", "D30", "(", "G2", "vs", "G4", ")", "and", ",", "FA", "16:1", "was", "similar", "for", "both", "comparison", "(", "D1", "and", "D30", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Considering", "the", "temporal", "treatment", "evaluation", "(", "G1", "vs", "G2", "and", "G3", "vs", "G4", ")", ",", "Fig.", "5d", "shows", "that", "1", "FA", ",", "4", "CE", ",", "1", "Cer", ",", "1", "TG", ",", "1", "PE", ",", "2", "SM", ",", "2", "LPC", "and", "5", "PC", "levels", "were", "affected", "by", "rosuvastatin", "therapy", "(", "G1", "vs", "G2", ")", ",", "2", "PC", "and", "only", "1", "PE", "levels", "were", "decreased", "only", "by", "simvastatin", "+", "ezetimibe", "treatment", "(", "G3", "vs", "G4", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "treatments", "promoted", "changes", "in", "the", "concentration", "levels", "of", "5", "FA", ",", "3", "LPC", ",", "5", "PE", ",", "7PC", "and", "6", "SM", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O" ]
[ "Figure", "5a", "shows", "that", ",", "LPC", "20:4", ",", "PE", "16:0_18:2", ",", "LPC", "17:0", ",", "LPC", "16:0", ",", "LPC", "18:1", ",", "SM", "18:1;O2/20:0", ",", "presented", "the", "largest", "alterations", "by", "the", "rosuvastatin", "treatment", "." ]
[ "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "largest", "alterations", "promoted", "by", "the", "simvastatin", "plus", "ezetimibe", "treatment", "were", "for", "PE", "16:0_18:2", ",", "LPC", "16:1", "and", "LPC", "20:4", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O" ]
[ "This", "study", "revealed", "differences", "in", "many", "lipid", "concentrations", "in", "subjects", "with", "STEMI", "despite", "comparable", "classic", "lipid", "profiles", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Disease", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "After", "highly", "effective", "lipid-lowering", "therapies", "(", "rosuvastatin", "or", "simvastatin", "+", "ezetimibe", ")", ",", "similar", "trend", "in", "the", "lipid", "composition", "were", "observed", "for", "both", "therapies", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "B-Metabolite", "O", "B-Metabolite", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "differences", "were", "noted", "between", "the", "lipid-lowering", "therapies", "for", "many", "lipids", "such", "as", "FA", ",", "LPC", ",", "PC", ",", "PE", ",", "CE", ",", "Cer", "and", "SM", "and", "these", "findings", "seem", "relevant", ",", "due", "to", "the", "involvement", "of", "these", "lipid", "classes", "in", "crucial", "mechanisms", "of", "atherosclerosis", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Disease", "O" ]
[ "These", "changes", "were", "more", "pronounced", "by", "rosuvastatin", "therapy", ",", "and", "the", "significant", "decrease", "in", "Cer", "observed", "only", "with", "this", "lipid-lowering", "drug", "seems", "important", ",", "as", "Cer", "has", "been", "considered", "a", "robust", "predictor", "for", "cardiovascular", "events", ",", "independently", "of", "LDL-C", "as", "well", "as", "for", "cardiovascular", "mortality", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "should", "be", "pointed", "out", "that", ",", "although", "in", "the", "lipid", "class", "evaluation", ",", "the", "sum", "of", "individual", "lipids", "from", "the", "same", "class", "presented", "significant", "changes", "only", "for", "SM", "class", "with", "simvastatin", "plus", "ezetimibe", "therapy", ",", "the", "statistical", "analysis", "of", "individual", "lipid", "species", "has", "not", "shown", "that", "the", "treatment", "altered", "lipids", "from", "many", "other", "classes", "(", "FA", ",", "PE", ",", "LPC", ",", "PC", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid" ]
[ "These", "findings", "highlight", "the", "importance", "of", "evaluating", "lipid", "species", "individually", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "fact", ",", "lipidomic", "studies", "have", "shown", "that", "PC", "containing", "polyunsaturated", "fatty", "acyl", "chains", "were", "negatively", "associated", "with", "CVD", "risk", ",", "while", "saturated", "and", "monounsaturated", "fatty", "acyl", "chains", "were", "deleterious", "for", "CVD", "risk", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Inflammation", "and", "oxidative", "stress", "have", "been", "considered", "as", "a", "part", "of", "the", "pathophysiology", "of", "acute", "coronary", "syndromes", "and", "their", "recurrences", "." ]
[ "B-Function", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "O", "B-Disease", "I-Disease", "I-Disease", "O", "O", "B-Disease", "O" ]
[ "Although", "FA", "and", "their", "esters", "constitute", "the", "major", "sources", "of", "energy", "for", "the", "heart", "muscle", ",", "their", "excess", "has", "profound", "effects", "on", "the", "heart", "causing", "an", "enhanced", "susceptibility", "to", "inflammation", ",", "oxidative", "stress", "and", "ischemic", "damage", "(", "fibrosis", "and", "hypertrophy", ")", "." ]
[ "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "B-Disease", "I-Disease", "O", "B-Disease", "O", "B-Disease", "O", "O" ]
[ "Different", "FA", "can", "be", "metabolized", "into", "pro-", "and", "anti-inflammatory", "signalling", "molecules", "." ]
[ "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PE", "and", "PC", "were", "reduced", "after", "treatment", "with", "both", "lipid-lowering", "therapies", "." ]
[ "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "unfolded", "protein", "response", "(", "UPR", ")", "is", "central", "to", "endoplasmic", "reticulum", "(", "ER", ")", "homeostasis", "by", "controlling", "its", "size", "and", "protein", "folding", "capacity", "." ]
[ "O", "B-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "O", "B-Function", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "I-Function", "O" ]
[ "Drug", "resistance", "elicited", "by", "cancer", "cells", "continue", "to", "cause", "huge", "problems", "world-wide", ",", "for", "example", ",", "tens", "of", "thousands", "of", "patients", "are", "suffering", "from", "taxol-resistant", "human", "ovarian", "cancer", "." ]
[ "B-Function", "I-Function", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Disease", "I-Disease", "I-Disease", "O" ]
[ "However", ",", "its", "biochemical", "mechanisms", "remain", "unclear", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "O", "O" ]
[ "Sphingolipid", "metabolic", "dysregulation", "has", "been", "increasingly", "regarded", "as", "one", "of", "the", "drug-resistant", "mechanisms", "for", "various", "cancers", ",", "which", "in", "turn", "provides", "potential", "targets", "for", "overcoming", "the", "resistance", "." ]
[ "B-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "O", "B-Disease", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "current", "study", ",", "a", "well-established", "LC-MS", "based", "sphingolipidomic", "approach", "was", "applied", "to", "investigate", "the", "sphingolipid", "metabolism", "of", "A2780", "and", "taxol-resistant", "A2780", "(", "A2780", "T", ")", "human", "ovarian", "cancer", "cell", "lines", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "O", "B-Assay Type", "I-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "B-CellType", "O", "O", "B-CellType", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O" ]
[ "102", "sphingolipids", "(", "SPLs", ")", "were", "identified", "based", "on", "accurate", "mass", "and", "characteristic", "fragment", "ions", ",", "among", "which", "12", "species", "have", "not", "been", "reported", "previously", "." ]
[ "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "89", "were", "further", "quantitatively", "analyzed", "by", "using", "multiple", "reaction", "monitoring", "technique", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Multivariate", "analysis", "revealed", "that", "the", "levels", "of", "52", "sphingolipids", "significantly", "altered", "in", "A2780", "T", "cells", "comparing", "to", "those", "of", "A2780", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "These", "alterations", "revealed", "an", "overall", "increase", "of", "sphingomyelin", "levels", "and", "significant", "decrease", "of", "ceramides", ",", "hexosylceramides", "and", "lactosylceramides", ",", "which", "concomitantly", "indicated", "a", "deviated", "SPL", "metabolism", "in", "A2780", "T", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "This", "is", "the", "most", "comprehensive", "sphingolipidomic", "analysis", "of", "A2780", "and", "A2780", "T", ",", "which", "investigated", "significantly", "changed", "sphingolipid", "profile", "in", "taxol-resistant", "cancer", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Distinguished", "from", "previous", "studies", ",", "this", "research", "of", "SPL", "took", "advantage", "of", "a", "well-established", "LC-MS", "method", ",", "and", "looked", "into", "the", "content", "variation", "of", "individual", "SPL", "species", "instead", "of", "the", "overall", "content", "of", "each", "subclass", ",", "thus", "provided", "much", "more", "detailed", "and", "useful", "information", "for", "revealing", "the", "mechanism", "of", "taxol-resistance", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Phosphatidylcholine", "(", "PC", ")", "is", "an", "abundant", "membrane", "lipid", "component", "in", "most", "eukaryotes", ",", "including", "yeast", ",", "and", "has", "been", "assigned", "multiple", "functions", "in", "addition", "to", "acting", "as", "building", "block", "of", "the", "lipid", "bilayer", "." ]
[ "B-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "B-Organism", "O", "O", "B-Organism", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "O" ]
[ "Here", ",", "by", "isolating", "S.", "cerevisiae", "suppressor", "mutants", "that", "exhibit", "robust", "growth", "in", "the", "absence", "of", "PC", ",", "we", "show", "that", "PC", "essentiality", "is", "subject", "to", "cellular", "evolvability", "in", "yeast", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-Organism", "I-Organism", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Organism", "O" ]
[ "The", "requirement", "for", "PC", "is", "suppressed", "by", "monosomy", "of", "chromosome", "XV", "or", "by", "a", "point", "mutation", "in", "the", "ACC1", "gene", "encoding", "acetyl‐CoA", "carboxylase", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "B-Organism Variant", "I-Organism Variant", "I-Organism Variant", "I-Organism Variant", "O", "O", "O", "B-Organism Variant", "I-Organism Variant", "O", "O", "B-Protein", "I-Protein", "O", "B-Protein", "I-Protein", "O" ]
[ "Although", "these", "two", "genetic", "adaptations", "rewire", "lipid", "biosynthesis", "in", "different", "ways", ",", "both", "decrease", "Acc1", "activity", ",", "thereby", "reducing", "average", "acyl", "chain", "length", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O" ]
[ "Consistently", ",", "soraphen", "A", ",", "a", "specific", "inhibitor", "of", "Acc1", ",", "rescues", "a", "yeast", "mutant", "with", "deficient", "PC", "synthesis", "." ]
[ "O", "O", "B-Metabolite", "I-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Protein", "O", "O", "O", "B-Organism Variant", "I-Organism Variant", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O" ]
[ "In", "the", "aneuploid", "suppressor", ",", "feedback", "inhibition", "of", "Acc1", "through", "acyl‐CoA", "produced", "by", "fatty", "acid", "synthase", "(", "FAS", ")", "results", "from", "upregulation", "of", "lipid", "synthesis", "." ]
[ "O", "O", "B-Organism Variant", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Protein", "O", "B-Protein", "O", "O", "B-Protein", "I-Protein", "I-Protein", "I-Protein", "I-Protein", "I-Protein", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O" ]
[ "The", "results", "show", "that", "budding", "yeast", "regulates", "acyl", "chain", "length", "by", "fine‐tuning", "the", "activities", "of", "Acc1", "and", "FAS", "and", "indicate", "that", "PC", "evolved", "by", "benefitting", "the", "maintenance", "of", "membrane", "fluidity", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-Organism", "I-Organism", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Protein", "O", "B-Protein", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "O" ]
[ "The", "glycerophospholipid", "phosphatidylcholine", "(", "PC", ")", "is", "an", "essential", "membrane", "lipid", "accounting", "for", "at", "least", "50", "%", "of", "total", "phospholipids", "in", "most", "eukaryotes", "(", "van", "Meer", "et", "al", ",", "2008", ")", "." ]
[ "O", "B-Lipid", "B-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Organism", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "exception", "is", "presented", "by", "several", "species", "of", "green", "algae", "that", "often", "contain", "the", "phosphorus‐free", "betaine", "lipid", "diacylglyceryl‐N", ",", "N", ",", "N‐trimethylhomoserine", "(", "DGTS", ")", "instead", "of", "PC", "(", "Sato", "&", "Furuya", ",", "1985", ";", "Giroud", "et", "al", ",", "1988", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Organism", "O", "B-Organism", "I-Organism", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "B-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "DGTS", "and", "PC", "both", "carry", "a", "quaternary", "amine‐containing", "zwitterionic", "head", "group", "and", "share", "similar", "biophysical", "properties", "(", "Sato", "&", "Murata", ",", "1991", ")", "." ]
[ "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PC", "is", "also", "present", "in", "more", "than", "10", "%", "of", "Bacteria", ",", "however", ",", "bacterial", "PC", "has", "not", "been", "assigned", "any", "essential", "function", "(", "Geiger", "et", "al", ",", "2013", ")", "." ]
[ "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Organism", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Besides", "its", "role", "as", "a", "building", "block", "of", "lipid", "bilayers", ",", "PC", "has", "regulatory", "functions", "in", "signal", "transduction", "and", "metabolic", "regulation", "in", "eukaryotes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Function", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "B-Organism", "O" ]
[ "For", "example", ",", "specific", "molecular", "species", "of", "PC", "serve", "as", "endogenous", "ligands", "for", "peroxisome", "proliferator‐activated", "receptor‐α", "(", "PPARα", ")", "and", "liver", "receptor", "homologue", "1", "(", "LRH1", ")", ",", "respectively", "(", "Chakravarthy", "et", "al", ",", "2009", ";", "Lee", "et", "al", ",", "2011", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "B-Function", "O", "B-Protein", "I-Protein", "I-Protein", "I-Protein", "I-Protein", "I-Protein", "O", "B-Protein", "I-Protein", "I-Protein", "I-Protein", "I-Protein", "I-Protein", "I-Protein", "I-Protein", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Loss‐of‐function", "mutations", "of", "key", "PC", "biosynthetic", "enzymes", "cause", "a", "wide", "spectrum", "of", "human", "pathologies", "(", "van", "der", "Veen", "et", "al", ",", "2017", ")", "." ]
[ "B-Organism Variant", "I-Organism Variant", "O", "O", "B-Lipid", "B-Function", "B-Protein", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Organism", "B-Disease", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "alterations", "in", "PC", "metabolism", "have", "been", "implicated", "in", "cancer", "(", "Ridgway", ",", "2013", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "B-Function", "O", "O", "O", "O", "B-Disease", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "By", "their", "sheer", "abundance", ",", "PC", "and", "its", "metabolic", "precursor", "phosphatidylethanolamine", "(", "PE", ")", "are", "important", "players", "in", "determining", "physical", "membrane", "properties", "such", "as", "membrane", "fluidity", "and", "intrinsic", "curvature", "that", "impact", "the", "function", "of", "membranes", "and", "membrane", "proteins", "(", "de", "Kroon", "et", "al", ",", "2013", ";", "Covino", "et", "al", ",", "2018", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "B-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "O", "O", "B-Function", "O", "B-Lipid", "O", "B-Protein", "I-Protein", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Whereas", "PC", "has", "an", "overall", "cylindrical", "molecular", "shape", "that", "makes", "it", "ideally", "suited", "to", "build", "the", "membrane", "bilayer", "matrix", ",", "PE", "is", "a", "lipid", "with", "non‐bilayer", "propensity", "that", "can", "adopt", "a", "conical", "shape", "depending", "on", "its", "acyl", "chain", "composition", "(", "Renne", "&", "de", "Kroon", ",", "2018", ")", "." ]
[ "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "increased", "PC/PE", "ratio", "induced", "by", "obesity", "in", "mouse", "liver", "was", "found", "to", "inhibit", "Ca", "transport", "by", "SERCA", ",", "causing", "ER", "stress", "(", "Fu", "et", "al", ",", "2011", ")", "." ]
[ "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "B-Disease", "O", "B-Organism", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "B-Function", "O", "B-Protein", "O", "O", "B-Disease", "I-Disease", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "decrease", "in", "PC/PE", "ratio", "in", "mouse", "liver", "induces", "steatohepatitis", "and", "ultimately", "causes", "liver", "failure", "due", "to", "loss", "of", "membrane", "integrity", "(", "Li", "et", "al", ",", "2006", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Organism", "B-Tissue", "O", "B-Disease", "O", "O", "O", "B-Disease", "I-Disease", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "B-Function", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "tolerance", "of", "the", "model", "eukaryote", "Saccharomyces", "cerevisiae", "towards", "variation", "in", "membrane", "lipid", "composition", ",", "makes", "it", "ideally", "suited", "for", "addressing", "the", "functions", "of", "lipid", "classes", "in", "membrane", "lipid", "homeostasis", "(", "de", "Kroon", "et", "al", ",", "2013", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Organism", "B-Organism", "I-Organism", "O", "O", "O", "B-Lipid", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "O", "B-Function", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "yeast", "double", "deletion", "mutant", "cho2opi3", "lacking", "the", "methyltransferases", "converting", "PE", "to", "PC", ",", "relies", "on", "supplementation", "with", "choline", "for", "the", "synthesis", "of", "PC", "by", "the", "CDP‐choline", "route", "(", "Fig", "1A", ")", "(", "Summers", "et", "al", ",", "1988", ";", "Kodaki", "&", "Yamashita", ",", "1989", ")", ",", "and", "has", "been", "used", "to", "manipulate", "cellular", "PC", "content", "." ]
[ "O", "B-Organism", "B-Organism Variant", "I-Organism Variant", "I-Organism Variant", "B-Organism Variant", "O", "O", "B-Protein", "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "B-Function", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O" ]
[ "Both", "DGTS", "and", "phosphatidyldimethylethanolamine", "(", "PDME", ")", ",", "a", "lipid", "containing", "two", "instead", "of", "three", "N‐methyl", "groups", "with", "physical", "properties", "similar", "to", "PC", ",", "can", "substitute", "for", "PC", "in", "cho2opi3", "(", "McGraw", "&", "Henry", ",", "1989", ";", "Boumann", "et", "al", ",", "2006", ";", "Riekhof", "et", "al", ",", "2014", ")", ",", "demonstrating", "that", "PC", "is", "dispensable", "for", "yeast", "growth", "." ]
[ "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "B-Organism Variant", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O" ]
[ "ACartoon", "depicting", "the", "biosynthetic", "pathways", "producing", "PC", "in", "yeast", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-Function", "I-Function", "O", "B-Lipid", "O", "B-Organism", "O" ]
[ "B10‐fold", "serial", "dilutions", "of", "1", "OD600", "unit/ml", "of", "the", "indicated", "strains", "were", "spotted", "on", "SD", "plates", "containing", "0", "(", "C", ")", "or", "1", "mM", "choline", "(", "C", ")", "and", "0", "(", "I", ")", "or", "75", "µM", "inositol", "(", "I", ")", "and", "incubated", "at", "30", "°", "C", "for", "3", "days", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "I-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Metabolite", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "representative", "experiment", "is", "shown", "(", "from", "n", "=", "5).C2D‐TLC", "analysis", "of", "total", "lipid", "extracts", "of", "coS#2", "cells", "cultured", "in", "SD", "CI", "and", "CI", ";", "ori", ",", "origin", ";", "NL", ",", "neutral", "lipids", "." ]
[ "O", "O", "B-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O" ]
[ "The", "lipid", "composition", "of", "human", "skin", "is", "essential", "for", "its", "function", ";", "however", "the", "simultaneous", "quantification", "of", "a", "wide", "range", "of", "stratum", "corneum", "(", "SC", ")", "and", "sebaceous", "lipids", "is", "not", "trivial", "." ]
[ "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Organism", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "B-Function", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "developed", "and", "validated", "a", "quantitative", "high-throughput", "shotgun", "mass", "spectrometry-based", "platform", "for", "lipid", "analysis", "of", "tape-stripped", "SC", "skin", "samples", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O" ]
[ "It", "features", "coverage", "of", "16", "lipid", "classes", ";", "total", "quantification", "to", "the", "level", "of", "individual", "lipid", "molecules", ";", "high", "reproducibility", "and", "high-throughput", "capabilities", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "B-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "O" ]
[ "With", "this", "method", "we", "conducted", "a", "large", "lipidomic", "survey", "of", "268", "human", "SC", "samples", ",", "where", "we", "investigated", "the", "relationship", "between", "sampling", "depth", "and", "lipid", "composition", ",", "lipidome", "variability", "in", "samples", "from", "14", "different", "sampling", "sites", "on", "the", "human", "body", "and", "finally", ",", "we", "assessed", "the", "impact", "of", "age", "and", "sex", "on", "lipidome", "variability", "in", "104", "healthy", "subjects", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Organism", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Organism", "I-Organism", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "found", "sebaceous", "lipids", "to", "constitute", "an", "abundant", "component", "of", "the", "SC", "lipidome", "as", "they", "diffuse", "into", "the", "topmost", "SC", "layers", "forming", "a", "gradient", "." ]
[ "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "B-Function", "I-Function", "I-Function", "O" ]
[ "Lipidomic", "variability", "with", "respect", "to", "sampling", "depth", ",", "site", "and", "subject", "is", "considerable", ",", "and", "mainly", "accredited", "to", "sebaceous", "lipids", ",", "while", "stratum", "corneum", "lipids", "vary", "less", "." ]
[ "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "B-Lipid", "O", "O", "O" ]
[ "This", "stresses", "the", "importance", "of", "sampling", "design", "and", "the", "role", "of", "sebaceous", "lipids", "in", "skin", "studies", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "B-Tissue", "O", "O" ]
[ "The", "primary", "function", "of", "the", "largest", "organ", "of", "the", "human", "body", "-", "skin", "-", "is", "to", "keep", "in", "what", "is", "inside", "and", "keep", "out", "what", "is", "outside", "." ]
[ "O", "O", "B-Function", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "B-Organism", "O", "O", "B-Tissue", "O", "B-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "I-Function", "O" ]
[ "This", "functionality", ",", "its", "physiology", "and", "pathophysiology", "are", "derivative", "of", "structure", "and", "composition", "of", "its", "topmost", "layer", ",", "the", "stratum", "corneum", "." ]
[ "O", "B-Function", "O", "O", "B-Function", "O", "B-Disease", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O" ]
[ "The", "SC", "consists", "of", "a", "layered", "meshwork", "of", "corneocytes", "sealed", "with", "lipids", "arranged", "in", "lamellar", "fashion", "." ]
[ "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "most", "abundant", "constituents", "of", "the", "lipid", "matrix", "are", "ceramides", "(", "Cer", ")", ",", "cholesterol", "(", "Chol", ")", "and", "free", "fatty", "acids1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "B-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Other", "classes", "found", "in", "SC", "include", "triacylglycerol", "(", "TAG", ")", ",", "diacylglycerol", "(", "DAG", ")", "and", "cholesterol", "esters", "(CE)2", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "B-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O" ]
[ "Lipidomic", "studies", "of", "skin", "have", "demonstrated", "that", "age", ",", "gender", ",", "ethnicity", ",", "and", "season", "of", "the", "year", "affect", "the", "skin", "lipid", "composition3", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Lipid", "O", "O" ]
[ "Likewise", ",", "alterations", "of", "lipid", "profiles", "were", "linked", "to", "dermatological", "and", "systemic", "diseases", ",", "like", "atopic", "dermatitis45", ",", "hereditary", "ichthyosis6", "or", "Netherton", "syndrome7", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "O", "O", "B-Disease", "I-Disease", "I-Disease", "I-Disease", "O", "O", "B-Disease", "I-Disease", "O", "B-Disease", "I-Disease", "O", "B-Disease", "I-Disease", "O" ]
[ "Early", "pioneering", "thin", "layer", "chromatography", "studies", "discerned", "8", "ceramide", "sub-classes8", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-Assay Type", "I-Assay Type", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O" ]
[ "The", "advent", "of", "mass", "spectrometry", "coupled", "with", "chromatographic", "separation", "of", "analytes", "(", "i.e.", "LC-MS", ")", "offered", "much", "increased", "sensitivity", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-Assay Type", "I-Assay Type", "O", "O", "B-Assay Type", "I-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "allowed", "further", "differentiation", "of", "ceramides", "into", "12", "ceramide", "sub-classes", "and", "identification", "of", "other", "lipid", "classes9101112", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O" ]
[ "These", "12", "ceramide", "sub-classes", "are", "defined", "by", "a", "combination", "of", "four", "different", "types", "of", "sphingoid", "bases", "(", "dehydrosphingosine", ",", "sphingosine", ",", "phytosphingosine", "and", "6-hydroxy", "sphingosine", ")", ",", "referred", "to", "as", "long", "chain", "base", "(", "LCB", ")", "with", "three", "different", "types", "of", "acyl", "chains", "(", "non-hydroxy", ",", "alpha-hydroxy", "and", "esterified", "omega-hydroxy", "fatty", "acid", "(FA))1", "." ]
[ "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O" ]
[ "A", "more", "recent", "approach", "to", "skin", "lipidomic", "analysis", "utilizes", "shotgun", "mass", "spectrometry", ",", "where", "the", "sample", "extract", "is", "subjected", "to", "mass", "spectra", "acquisition", "without", "prior", "chromatographic", "separation", "(", "direct", "infusion)1314", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "B-Lipid", "O", "O", "B-Assay Type", "I-Assay Type", "I-Assay Type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Assay Type", "I-Assay Type", "I-Assay Type", "O", "O", "B-Assay Type", "I-Assay Type", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "technology", "was", "applied", "for", "the", "analysis", "of", "non-hydroxy", "and", "alpha-hydroxy", "ceramides", ",", "but", "it", "did", "not", "allow", "for", "absolute", "quantification", "or", "for", "the", "distinction", "between", "all", "ceramide", "sub-classes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Lipid", "I-Lipid", "O" ]