tokens
listlengths 1
168
| tags
listlengths 1
168
|
|---|---|
[
"All",
"other",
"classes",
"were",
"not",
"significantly",
"altered",
"by",
"the",
"intervention",
"(",
"Fig",
"3A",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"compare",
"the",
"abundance",
"of",
"individual",
"lipid",
"species",
"between",
"the",
"4",
"groups",
",",
"we",
"used",
"a",
"linear",
"model",
"and",
"performed",
"three",
"tests",
"to",
"capture",
"the",
"effects",
"of",
"the",
"genotype",
"(",
"wt",
";",
"atATGL-KO",
")",
",",
"the",
"intervention",
"(",
"sham",
";",
"TAC",
")",
"and",
"the",
"sum",
"of",
"both",
"and",
"their",
"interaction",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Multiple",
"testing",
"correction",
"was",
"applied",
",",
"and",
"all",
"lipid",
"species",
"with",
"a",
"significant",
"p-value",
"(",
"adjusted",
")",
"in",
"at",
"least",
"one",
"test",
"are",
"shown",
"in",
"the",
"heat",
"map",
"(",
"Fig",
"3B",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Data",
"for",
"each",
"lipid",
"species",
"are",
"presented",
"as",
"row",
"z-scores",
"of",
"the",
"mean",
"log2-transformed",
"relative",
"values",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"complete",
"data",
"set",
"of",
"the",
"analysis",
"is",
"shown",
"in",
"S2",
"Table",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"MS-based",
"shotgun",
"lipidomics",
"analysis",
"of",
"heart",
"tissue",
"samples",
"(",
"LV",
")",
"isolated",
"11",
"weeks",
"after",
"intervention",
"(",
"sham",
"or",
"TAC",
")",
"from",
"wild-type",
"(",
"wt",
")",
"or",
"atATGL-KO",
"mice",
"."
] |
[
"B-Assay Type",
"I-Assay Type",
"I-Assay Type",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O"
] |
[
"A",
":",
"For",
"each",
"lipid",
"class",
",",
"mean",
"total",
"mole",
"percent",
"values",
"Β±",
"SEM",
"are",
"shown",
"on",
"a",
"logarithmic",
"scale",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"test",
"for",
"differential",
"changes",
",",
"a",
"Mann-Whitney",
"U",
"test",
"between",
"sham",
"and",
"TAC",
"in",
"wt-",
"and",
"atATGL-KO",
"mice",
",",
"respectively",
",",
"was",
"performed",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Adjusted",
"p-values",
"are",
"indicated",
":",
"*",
"p<0.05",
"vs.",
"wt",
"sham",
",",
"*",
"*",
"p<0.01",
"vs.",
"wt",
"sham",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"O"
] |
[
"B",
":",
"Differentially",
"regulated",
"lipid",
"species",
"were",
"filtered",
"by",
"testing",
"for",
"the",
"effect",
"of",
"the",
"genotype",
"(",
"wt",
";",
"atATGL-KO",
")",
",",
"the",
"intervention",
"(",
"sham",
";",
"TAC",
")",
"and",
"the",
"sum",
"of",
"both",
"plus",
"their",
"interaction",
"using",
"a",
"linear",
"model",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Species",
"with",
"an",
"FDR",
"adjusted",
"p-value",
"<",
"0.1",
"in",
"at",
"least",
"one",
"test",
"were",
"retained",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Hierarchical",
"clustering",
"of",
"the",
"corresponding",
"t-statistics",
"yielded",
"four",
"distinct",
"groups",
":",
"lipid",
"species",
"upregulated",
"in",
"TAC",
"(",
"blue",
")",
",",
"upregulated",
"in",
"atATGL-KO",
"(",
"red",
")",
",",
"downregulated",
"in",
"atATGL-KO",
"(",
"green",
")",
",",
"downregulated",
"in",
"TAC",
"(",
"black",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Data",
"for",
"each",
"lipid",
"species",
"are",
"presented",
"as",
"row",
"scaled",
"z-scores",
"of",
"mean",
"log-transformed",
"relative",
"changes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Lipid",
"classes",
":",
"Cer",
":",
"ceramide",
",",
"Chol",
":",
"cholesterol",
",",
"CL",
":",
"cardiolipin",
",",
"DAG",
":",
"diacylglycerol",
",",
"LPC",
":",
"lyso-phosphatidylcholine",
",",
"LPE",
":",
"lyso-phosphatidylethanolamine",
",",
"LPE",
"O-",
":",
"lyso-phosphatidylethanolamine-ether",
",",
"LPI",
":",
"lyso-phosphatidylinositol",
",",
"LPS",
":",
"lyso-phosphatidylserine",
",",
"PC",
":",
"phosphatidylcholine",
",",
"PC",
"O-",
":",
"phosphatidylcholine-ether",
",",
"PE",
":",
"phosphatidylethanolamine",
",",
"PE",
"O-",
":",
"phosphatidylethanolamine-ether",
",",
"PG",
":",
"phosphatidylglycerol",
",",
"PI",
":",
"phosphatidylinositol",
",",
"PS",
":",
"phosphatidylserine",
",",
"SM",
":",
"sphingomyelin",
",",
"TAG",
":",
"triacylglycerol",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O"
] |
[
"Among",
"the",
"identified",
"lipid",
"species",
",",
"the",
"most",
"significant",
"change",
"was",
"an",
"increase",
"in",
"individual",
"PE",
"species",
"in",
"failing",
"wt-hearts",
"(",
"TAC",
")",
"compared",
"to",
"wt-sham",
"hearts",
"(",
"Fig",
"3B",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"increase",
"was",
"clearly",
"attenuated",
"in",
"mice",
"lacking",
"adipose",
"ATGL",
"comparing",
"atATGL-KO",
"TAC",
"mice",
"and",
"their",
"sham",
"controls",
"(",
"Fig",
"3B",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism",
"O",
"O",
"B-Protein",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"similar",
"effect",
"was",
"detected",
"for",
"two",
"sphingomyelins",
"(",
"SM",
")",
",",
"SM34:1",
"and",
"SM42:2",
",",
"for",
"phosphatidylglycerol",
"(",
"PG",
")",
",",
"PG16:0β20:4",
",",
"and",
"for",
"phosphatidylinositol",
"(",
"PI",
")",
",",
"PI20:4β18:0",
"(",
"Fig",
"3B",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"other",
"lipid",
"species",
"were",
"markedly",
"downregulated",
"in",
"failing",
"hearts",
"from",
"wt-mice",
",",
"an",
"effect",
"broadly",
"extenuated",
"in",
"atATGL-KO",
"mice",
"(",
"Fig",
"3B",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"specific",
"lipid",
"species",
"reduced",
"by",
"pressure-overload",
"in",
"wt-mice",
"included",
"PC",
"O",
"16:1β22:6",
",",
"Cers",
"(",
"Cer36:1",
";",
"Cer38:1",
";",
"Cer38:2",
")",
",",
"and",
"the",
"CL76:12",
"(",
"Fig",
"3B",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"I-Lipid",
"I-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"downregulation",
"was",
"attenuated",
"in",
"atATGL-KO",
"mice",
"(",
"Fig",
"3B",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Comparison",
"of",
"wt-",
"and",
"atATGL-KO",
"mice",
"independent",
"of",
"the",
"intervention",
"revealed",
"primarily",
"changes",
"of",
"a",
"small",
"number",
"of",
"lipid",
"species",
"including",
"the",
"species",
"from",
"the",
"PC",
"class",
":",
"upregulation",
"of",
"PC20:4β16:1",
"and",
"PC18:0β18:1",
"and",
"downregulation",
"of",
"PC18:2β15:0",
"and",
"PC18:2β17:1",
"(",
"Fig",
"3B",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"summary",
",",
"lack",
"of",
"ATGL",
"in",
"adipose",
"tissue",
"and",
"reduced",
"lipolysis",
"associated",
"with",
"the",
"reduction",
"of",
"selected",
"circulating",
"FAs",
"mediates",
"pressure-induced",
"modifications",
"of",
"distinct",
"cardiac",
"lipid",
"species",
"among",
"which",
"PEs",
"display",
"the",
"most",
"apparent",
"regulation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Protein",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"O",
"O",
"B-Function",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Metabolite",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"order",
"to",
"better",
"understand",
"the",
"degree",
"and",
"relevance",
"of",
"cardiac",
"lipid",
"changes",
"during",
"LV",
"failure",
",",
"we",
"performed",
"an",
"in-depth",
"analysis",
"of",
"all",
"lipid",
"classes",
"in",
"which",
"the",
"log2-fold",
"change",
"(",
"sham",
"vs.",
"TAC",
")",
",",
"and",
"the",
"concentration",
"of",
"each",
"lipid",
"species",
"(",
"mean",
"mole",
"%",
")",
"was",
"included",
"in",
"a",
"pairwise",
"comparison",
"(",
"sham",
"vs.",
"TAC",
")",
"in",
"wt",
"and",
"atATGL-KO",
"mice",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Assay Type",
"O",
"B-Assay Type",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O"
] |
[
"Fig",
"4A",
"and",
"4B",
"provides",
"an",
"overview",
"of",
"all",
"lipid",
"classes",
"and",
"species",
"in",
"wt",
"and",
"atATGL-KO",
"mice",
",",
"respectively",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"overall",
"extent",
"of",
"regulation",
"of",
"cardiac",
"lipid",
"species",
"in",
"sham",
"vs.",
"TAC",
"mice",
"was",
"obviously",
"greater",
"in",
"wt-mice",
"compared",
"to",
"atATGL-KO",
"mice",
",",
"as",
"reflected",
"by",
"the",
"vertical",
"distribution",
"pattern",
"on",
"the",
"scatter",
"plot",
"(",
"Fig",
"4A",
"and",
"4B",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"TAC-induced",
"regulation",
"of",
"lipid",
"species",
"in",
"wt-hearts",
"(",
"Fig",
"4A",
",",
"triangles",
")",
"was",
"robustly",
"attenuated",
"in",
"atATGL-KO",
"mice",
"(",
"Fig",
"4B",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Detailed",
"evaluation",
"of",
"each",
"regulated",
"lipid",
"class",
"revealed",
"a",
"total",
"of",
"10",
"PE-species",
"significantly",
"upregulated",
"during",
"LV",
"failure",
"in",
"wt-hearts",
"containing",
"mostly",
"saturated",
",",
"mono-",
"or",
"polyunsaturated",
"long-chain",
"FAs",
"(",
"Fig",
"4C",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Metabolite",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"PE",
"with",
"the",
"highest",
"concentration",
"in",
"wt",
"LV",
"samples",
"(",
"PE18:0β20:4",
")",
"exhibited",
"an",
"induction",
"of",
"1.4-fold",
"over",
"sham",
"controls",
"(",
"Fig",
"4C",
")",
"."
] |
[
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"maximum",
"PE",
"induction",
"by",
"TAC",
"intervention",
"was",
"2.1-fold",
"over",
"sham",
"for",
"PE16:0β20:4",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O"
] |
[
"Some",
"PE-species",
"in",
"the",
"higher",
"concentration",
"range",
"were",
"not",
"significantly",
"regulated",
"by",
"TAC",
"(",
"Fig",
"4C",
",",
"circles",
")",
",",
"likely",
"explaining",
"the",
"absence",
"of",
"a",
"statistical",
"significant",
"regulation",
"of",
"the",
"total",
"PE",
"class",
",",
"as",
"shown",
"in",
"Fig",
"3A",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Induction",
"of",
"significantly",
"regulated",
"PEs",
"during",
"heart",
"failure",
"development",
"was",
"absent",
"in",
"atATGL-KO",
"mice",
"(",
"Fig",
"4D",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"we",
"identified",
"4",
"ether-PEs",
"(",
"PE",
"O-",
")",
"containing",
"a",
"fatty",
"alcohol",
"instead",
"of",
"a",
"fatty",
"acid",
"at",
"the",
"sn1-position",
"which",
"were",
"upregulated",
"in",
"failing",
"wt-hearts",
"but",
"not",
"in",
"atATGL-KO",
"hearts",
"(",
"Fig",
"4C",
"and",
"4D",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Among",
"the",
"PE",
"O-s",
",",
"PE",
"O-",
"16:0β20:4",
"showed",
"the",
"most",
"dramatic",
"induction",
"over",
"sham",
"controls",
"in",
"wt",
"mice",
"(",
"3.1-fold",
"over",
"sham",
")",
"(",
"Fig",
"4C",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"accordance",
"to",
"the",
"diacyl",
"PE",
"regulation",
",",
"hearts",
"from",
"atATGL-KO",
"mice",
"lacked",
"the",
"significant",
"PE",
"O-",
"induction",
"after",
"TAC",
"(",
"Fig",
"4D",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"majority",
"of",
"the",
"differentially",
"regulated",
"PE-",
"and",
"PE",
"O-",
"species",
"in",
"failing",
"wt-hearts",
"contained",
"at",
"least",
"one",
"FA",
"from",
"the",
"depleted",
"blood",
"FA",
"pool",
"(",
"C16:0",
",",
"C16:1",
";",
"C18:1",
",",
"C18:2",
",",
"C20:5",
",",
"Fig",
"2E",
")",
"in",
"atATGL-KO",
"mice",
"(",
"Fig",
"4C",
")",
",",
"suggesting",
"a",
"link",
"between",
"blood",
"FAs",
"and",
"cardiac",
"lipid",
"species",
"in",
"the",
"present",
"model",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Metabolite",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"B-Metabolite",
"O",
"O",
"B-Metabolite",
"O",
"B-Metabolite",
"O",
"B-Metabolite",
"O",
"B-Metabolite",
"O",
"B-Metabolite",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"B-Metabolite",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
"to",
"the",
"PE-",
"and",
"PE",
"O",
"species",
",",
"PC-",
"and",
"PC",
"O-",
"species",
"were",
"not",
"significantly",
"regulated",
"in",
"failing",
"wt-hearts",
",",
"or",
"in",
"atATGL-KO",
"hearts",
"(",
"Fig",
"4E",
"and",
"4F",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"MS-based",
"shotgun",
"lipidomics",
"analysis",
"of",
"heart",
"tissue",
"samples",
"(",
"LV",
")",
"isolated",
"11",
"weeks",
"after",
"intervention",
"(",
"sham",
"or",
"TAC",
")",
"from",
"wild-type",
"(",
"wt",
")",
"or",
"atATGL-KO",
"mice",
"."
] |
[
"B-Assay Type",
"I-Assay Type",
"I-Assay Type",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O"
] |
[
"Lipid",
"class",
"denotations",
"see",
"Fig",
"3",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A-F",
":",
"Mean",
"log2-fold",
"change",
"(",
"TAC",
"vs.",
"sham",
")",
"vs.",
"mean",
"mole",
"percent",
"of",
"lipid",
"species",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Triangles",
"represent",
"significantly",
"changed",
"lipid",
"species",
"(",
"FDR",
"adjusted",
"p-value",
"<",
"0.1",
"and",
"absolute",
"value",
"of",
"log2-fold",
"change",
"β₯",
"0.5",
")",
";",
"bubbles",
"represent",
"those",
"which",
"are",
"not",
"significantly",
"changed",
";",
"size",
"indicates",
"log-transformed",
"adjusted",
"p-values",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
",",
"C",
",",
"E",
":",
"wt-mice",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O"
] |
[
"B",
",",
"D",
",",
"F",
":",
"atATGL-KO-mice",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O"
] |
[
"G+H",
":",
"Significantly",
"changed",
"PC-PE",
"ratios",
"of",
"matched",
"FAs",
"in",
"wt-mice",
"(",
"G",
")",
"or",
"atATGL-KO",
"mice",
"(",
"H",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Metabolite",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"mean",
"ratio",
"Β±",
"SEM",
"is",
"shown",
"on",
"a",
"logarithmic",
"scale",
",",
"Mann-Whitney",
"U",
"test",
"for",
"TAC",
"vs.",
"sham",
":",
"*",
"p<0.05",
",",
"*",
"*",
"p<0.01",
"(",
"adjusted",
")",
"in",
"wt-mice",
",",
"no",
"significant",
"changes",
"were",
"found",
"in",
"at",
"ATGL-KO",
"mice",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O"
] |
[
"I",
":",
"upper",
"panels",
":",
"WB",
"analysis",
"of",
"heart",
"lysates",
"using",
"antibodies",
"against",
"cleaved",
"caspase",
"3",
"and",
"Bcl-associated",
"X",
"protein",
"(",
"Bax",
")",
";",
"lower",
"panel",
":",
"WB",
"analysis",
"of",
"HL-1",
"cardiomyocytes",
"lysates",
"from",
"cells",
"stimulated",
"with",
"vehicle",
"(",
"Veh",
")",
"or",
"fatty",
"acid",
"(",
"FA",
")",
"mix",
"(",
"C16:0",
",",
"C18:1,C18:2",
"in",
"different",
"concentrations",
")",
"using",
"antibodies",
"against",
"cleaved",
"caspase",
"3",
";",
"loading",
"control",
":",
"Ξ²",
"β",
"actin",
",",
"glyceraldehyde",
"3-phosphate",
"dehydrogenase",
"(",
"GAPDH",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Protein",
"I-Protein",
"O",
"B-Protein",
"I-Protein",
"I-Protein",
"O",
"B-Protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Assay Type",
"I-Assay Type",
"O",
"O",
"B-CellType",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Metabolite",
"I-Metabolite",
"O",
"B-Metabolite",
"O",
"O",
"O",
"B-Metabolite",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Protein",
"I-Protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Protein",
"I-Protein",
"I-Protein",
"O",
"B-Protein",
"I-Protein",
"I-Protein",
"O",
"B-Protein",
"O",
"O"
] |
[
"Recently",
",",
"a",
"decrease",
"of",
"the",
"PC/",
"PE",
"ratio",
"has",
"been",
"identified",
"to",
"regulate",
"cell",
"membrane",
"integrity",
"in",
"hepatocytes",
",",
"and",
"was",
"accompanied",
"by",
"pronounced",
"cell",
"damage",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellType",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"we",
"calculated",
"the",
"ratio",
"of",
"the",
"identified",
"PCs",
"and",
"PEs",
"matched",
"for",
"bound",
"FAs",
"in",
"our",
"model",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-Metabolite",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"agreement",
"with",
"the",
"decline",
"of",
"LV",
"function",
"in",
"TAC-operated",
"wt-mice",
",",
"cardiac",
"PC/",
"PE-ratios",
"were",
"reduced",
"in",
"failing",
"wt-hearts",
"compared",
"to",
"wt-sham",
"hearts",
"(",
"Fig",
"4",
"G",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"atATGL-KO",
"mice",
",",
"PC/",
"PE",
"ratios",
"did",
"not",
"significantly",
"differ",
"between",
"sham-",
"and",
"TAC-mice",
"(",
"Fig",
"4H",
")",
"."
] |
[
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"highest",
"ratio",
"was",
"detected",
"in",
"wt-sham",
"hearts",
"(",
"S3",
"Table",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Since",
"the",
"decrease",
"of",
"PC/",
"PE",
"ratios",
"has",
"been",
"associated",
"with",
"cell",
"damage",
",",
"we",
"evaluated",
"the",
"expression",
"of",
"the",
"pro-apoptotic",
"markers",
"cleaved",
"caspase",
"3",
"and",
"Bax",
"in",
"LV",
"samples",
"from",
"sham-",
"and",
"TAC-operated",
"wt-",
"and",
"atATGL-KO",
"mice",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Protein",
"I-Protein",
"O",
"B-Protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O"
] |
[
"As",
"shown",
"in",
"Fig",
"4I",
"(",
"upper",
"panels",
")",
",",
"both",
"proteins",
"were",
"induced",
"in",
"failing",
"LVs",
"from",
"wt-mice",
"but",
"not",
"atATGL-KO",
"mice",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O"
] |
[
"In",
"accordance",
",",
"when",
"HL-1",
"cardiomyocytes",
"were",
"stimulated",
"with",
"FAs",
"(",
"C16:0",
",",
"C18:1",
",",
"C18:2",
")",
"regulated",
"by",
"ATGL",
"in-vivo",
",",
"we",
"detected",
"increased",
"apoptosis",
"by",
"cleaved",
"caspase",
"3",
"protein",
"expression",
"(",
"Fig",
"4I",
"lower",
"panel",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellType",
"O",
"O",
"O",
"B-Metabolite",
"O",
"B-Metabolite",
"I-Metabolite",
"B-Metabolite",
"O",
"B-Metabolite",
"O",
"O",
"O",
"B-Protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Function",
"O",
"O",
"B-Protein",
"I-Protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Cleaved",
"caspase",
"3",
"was",
"not",
"induced",
"in",
"HL-1",
"cells",
"under",
"physiological",
"high",
"serum",
"conditions",
"(",
"S1D",
"Fig",
")",
"suggesting",
"that",
"increased",
"FA-levels",
"are",
"required",
"for",
"the",
"induction",
"of",
"apoptosis",
"in",
"these",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"B-Protein",
"I-Protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellType",
"I-CellType",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Function",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"summary",
",",
"these",
"data",
"demonstrate",
"that",
"pressure-mediated",
"LV",
"failure",
"is",
"associated",
"with",
"an",
"increase",
"of",
"distinct",
"cardiac",
"PE-species",
"leading",
"to",
"a",
"reduction",
"of",
"cardiac",
"PC/PE",
"ratios",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"decline",
"of",
"PC/",
"PE",
"ratios",
"is",
"accompanied",
"by",
"the",
"enhanced",
"expression",
"of",
"cardiac",
"apoptosis",
"markers",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"B-Function",
"O",
"O"
] |
[
"Deficiency",
"of",
"adipose",
"tissue",
"ATGL",
"prevents",
"cardiac",
"PE",
"upregulation",
"in",
"an",
"FA-specific",
"manner",
"and",
"protects",
"the",
"heart",
"against",
"LV",
"failure",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"B-Protein",
"O",
"B-Tissue",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O"
] |
[
"To",
"explore",
"the",
"relevance",
"of",
"our",
"findings",
"to",
"LV",
"failure",
"in",
"humans",
",",
"we",
"performed",
"shotgun",
"lipidomics",
"analysis",
"using",
"plasma",
"samples",
"obtained",
"from",
"male",
"patients",
"with",
"HFrEF",
"(",
"n",
"=",
"13",
")",
"and",
"male",
"control",
"subjects",
"with",
"normal",
"LV",
"function",
"(",
"n",
"=",
"10",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"B-Organism",
"O",
"O",
"O",
"B-Assay Type",
"I-Assay Type",
"I-Assay Type",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Function",
"I-Function",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"clinical",
"characteristics",
"of",
"both",
"groups",
"are",
"outlined",
"in",
"Table",
"1",
"and",
"S4",
"Table",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Patients",
"with",
"HFrEF",
"had",
"a",
"mean",
"LVEF",
"of",
"25",
"Β±",
"4.8",
"%",
"compared",
"to",
"60.9",
"Β±",
"3.3",
"%",
"in",
"the",
"control",
"group",
"(",
"Table",
"1",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-Disease",
"O",
"O",
"O",
"B-Function",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"HFrEF",
"patients",
"were",
"on",
"average",
"older",
"than",
"subjects",
"in",
"the",
"control",
"group",
"and",
"had",
"a",
"slightly",
"higher",
"BMI",
"(",
"Table",
"1",
")",
"."
] |
[
"B-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Shown",
"are",
"means",
"Β±",
"SD",
",",
"[",
"min.-max",
".",
"]",
","
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"or",
"[",
"%",
"]",
";",
"MI",
":",
"myocardial",
"infarction",
";",
"LV",
":",
"left",
"ventricular",
"We",
"analyzed",
"147",
"lipid",
"species",
"from",
"13",
"lipid",
"classes",
"in",
"human",
"plasma",
"(",
"S5",
"Table",
"and",
"Fig",
"5A",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"PCs",
",",
"TAGs",
",",
"sterols",
"(",
"ST",
")",
"and",
"sterol",
"esters",
"(",
"SE",
")",
"were",
"found",
"in",
"the",
"highest",
"concentration",
"in",
"human",
"plasma",
"(",
"Fig",
"5A",
")",
"."
] |
[
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"HFrEF",
"patients",
"had",
"significantly",
"higher",
"plasma",
"levels",
"of",
"PEs",
"and",
"PIs",
",",
"and",
"lower",
"plasma",
"levels",
"of",
"SE",
"compared",
"to",
"controls",
"(",
"Fig",
"5A",
")",
"."
] |
[
"B-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"subsequently",
"analyzed",
"the",
"individual",
"lipid",
"species",
"within",
"a",
"lipid",
"class",
"and",
"detected",
"10",
"plasma",
"lipid",
"species",
"which",
"were",
"significantly",
"differentially",
"regulated",
"between",
"controls",
"and",
"HFrEF",
"patients",
"using",
"a",
"linear",
"model",
"to",
"account",
"for",
"age",
"and",
"BMI",
"(",
"Fig",
"5B",
",",
"triangles",
",",
"and",
"Fig",
"5C",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"O",
"O",
"O",
"B-Assay Type",
"I-Assay Type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Among",
"the",
"regulated",
"lipid",
"species",
",",
"3",
"PE",
"species",
"(",
"PE16:0β18:1",
",",
"PE16:0β18:2",
",",
"PE18:2β18:0",
")",
"were",
"significantly",
"higher",
"in",
"blood",
"plasma",
"from",
"HFrEF",
"patients",
"compared",
"to",
"controls",
"(",
"Fig",
"5B",
"and",
"5C",
",",
"S5",
"Table",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"O",
"B-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Interestingly",
",",
"all",
"of",
"the",
"PE",
"species",
"with",
"increased",
"levels",
"in",
"blood",
"plasma",
"from",
"HFrEF",
"patients",
"were",
"also",
"upregulated",
"in",
"the",
"hearts",
"of",
"wt",
"mice",
"with",
"LV",
"failure",
"(",
"Fig",
"4C",
")",
",",
"suggesting",
"a",
"link",
"between",
"circulating",
"and",
"cardiac",
"PE",
"levels",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"O",
"B-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"B-Organism",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"strongest",
"rise",
"was",
"observed",
"for",
"PE16:0β18:2",
",",
"with",
"5.6-fold",
"higher",
"levels",
"in",
"HFrEF",
"compared",
"to",
"controls",
"(",
"S5",
"Table",
"and",
"Fig",
"5B",
"and",
"5C",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"line",
"with",
"the",
"increase",
"in",
"PEs",
",",
"distinct",
"DAG",
"species",
"(",
"which",
"are",
"known",
"precursors",
"of",
"PEs",
")",
"were",
"higher",
"in",
"HFrEF",
"patients",
"including",
"DAG16:0β18:2",
"and",
"DAG18:2β18:2",
"(",
"S5",
"Table",
"and",
"Fig",
"5B",
"and",
"5C",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
"to",
"the",
"mouse",
"data",
",",
"we",
"discovered",
"two",
"PC",
"species",
"(",
"PC16:0β16:0",
",",
"PC17:1β16:0",
")",
"and",
"Cer38:1",
"upregulated",
",",
"and",
"2",
"PC",
"O-",
"species",
"(",
"PC",
"O-",
"16:1β16:0",
",",
"PC",
"O-",
"18:2β18:2",
")",
"downregulated",
"in",
"plasma",
"from",
"HFrEF",
"patients",
"(",
"S5",
"Table",
"and",
"Fig",
"5B",
"and",
"5C",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"B-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"PC",
"O-",
"species",
"were",
"depleted",
"from",
"the",
"same",
"FAs",
"(",
"C16:0",
";",
"C16:1",
",",
"and",
"C18:2",
")",
"which",
"were",
"concurrently",
"increased",
"in",
"PE",
"species",
",",
"suggesting",
"a",
"possibility",
"of",
"selective",
"FA",
"partitioning",
"to",
"distinct",
"glycerophospholipid",
"classes",
"in",
"HFrEF",
"(",
"S5",
"Table",
"and",
"Fig",
"5B",
"and",
"5C",
")",
"."
] |
[
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"B-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
":",
"Box",
"plots",
"show",
"distribution",
"of",
"total",
"mole",
"percent",
"values",
"for",
"each",
"lipid",
"class",
"corrected",
"for",
"age",
"and",
"BMI",
"(",
"see",
"supplementary",
"methods",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"test",
"for",
"differential",
"changes",
"a",
"Mann-Whitney",
"U",
"test",
"between",
"HFrEF-patients",
"and",
"controls",
"was",
"performed",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Adjusted",
"p-values",
"are",
"indicated",
":",
"*",
"p<0.05",
",",
"*",
"*",
"p<0.01",
",",
"*",
"*",
"p<0.001",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"B",
":",
"Estimated",
"mean",
"log2",
"fold",
"change",
"(",
"HFrEF",
"vs.",
"control",
")",
"vs.",
"estimated",
"mean",
"mole",
"percent",
"of",
"lipid",
"species",
"in",
"the",
"control",
"group",
"(",
"see",
"supplementary",
"methods",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Triangles",
"represent",
"significantly",
"changed",
"lipid",
"species",
"(",
"FDR",
"adjusted",
"p-value",
"<",
"0.1",
"and",
"absolute",
"value",
"of",
"log2-fold",
"change",
"β₯",
"0.5",
")",
",",
"bubbles",
"show",
"those",
"which",
"are",
"not",
"significantly",
"changed",
",",
"size",
"indicates",
"log-transformed",
"adjusted",
"p-values",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"C",
":",
"Bar",
"graph",
"shows",
"the",
"estimated",
"log2-fold",
"change",
"(",
"HFrEF",
"vs.",
"control",
")",
"Β±",
"regression",
"standard",
"error",
"of",
"differentially",
"changed",
"lipid",
"species",
"(",
"see",
"B.",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Colors",
"represent",
"log10",
"adjusted",
"p-values",
"as",
"indicated",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Lipid",
"classes",
":",
"Cer",
":",
"ceramide",
",",
"DAG",
":",
"diacylglycerol",
",",
"LPC",
":",
"lyso-phosphatidylcholine",
",",
"LPE",
":",
"lyso-phosphatidylethanolamine",
",",
"PC",
":",
"phosphatidylcholine",
",",
"PC",
"O-",
":",
"phosphatidylcholine-ether",
",",
"PE",
":",
"phosphatidylethanolamine",
",",
"PE",
"O-",
":",
"phosphatidylethanolamine-ether",
",",
"PI",
":",
"phosphatidylinositol",
",",
"SE",
":",
"sterol",
"ester",
",",
"SM",
":",
"sphingomyelin",
",",
"ST",
":",
"sterols",
",",
"TAG",
":",
"triacylglycerol",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"B-Lipid",
"O"
] |
[
"Taken",
"together",
",",
"our",
"data",
"from",
"human",
"plasma",
"samples",
"demonstrate",
"that",
"the",
"presence",
"of",
"HFrEF",
"is",
"accompanied",
"by",
"a",
"dysregulation",
"of",
"individual",
"lipid",
"classes",
"and",
"lipid",
"species",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Function",
"I-Function",
"I-Function",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"I-Function",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O"
] |
[
"Interestingly",
",",
"comparable",
"changes",
"in",
"PE",
"species",
"were",
"observed",
"in",
"failing",
"mouse",
"hearts",
"and",
"in",
"plasma",
"from",
"HFrEF",
"patients",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"B-Disease",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"study",
",",
"we",
"demonstrated",
"for",
"the",
"first",
"time",
"that",
"pressure-induced",
"cardiac",
"failure",
"is",
"accompanied",
"by",
"marked",
"changes",
"in",
"the",
"cardiac",
"lipidome",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"most",
"robust",
"alteration",
"in",
"lipid",
"species",
"was",
"an",
"upregulation",
"of",
"distinct",
"PE",
"species",
"in",
"failing",
"wt-hearts",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Perturbation",
"of",
"adipose",
"tissue",
"lipolysis",
"in",
"atATGL-KO",
"mice",
"led",
"to",
"an",
"improvement",
"of",
"pressure-induced",
"heart",
"failure",
"accompanied",
"by",
"the",
"prevention",
"of",
"cardiac",
"PE",
"induction",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"B-Function",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"B-Lipid",
"O",
"O"
] |
[
"Pressure-induced",
"cardiac",
"PE",
"induction",
"resulted",
"in",
"a",
"decreased",
"PC/",
"PE-ratio",
"and",
"a",
"concurrent",
"increase",
"in",
"apoptotic",
"marker",
"expression",
"in",
"failing",
"wt-hearts",
",",
"a",
"process",
"which",
"was",
"absent",
"in",
"atATGL-KO",
"hearts",
"."
] |
[
"O",
"B-Tissue",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Assay Type",
"I-Assay Type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Function",
"I-Function",
"I-Function",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O"
] |
[
"Taken",
"together",
",",
"this",
"study",
"demonstrates",
"that",
"the",
"cardiac",
"lipidome",
"undergoes",
"profound",
"changes",
"during",
"heart",
"failure",
"development",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"I-Lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"absence",
"of",
"these",
"changes",
"in",
"atATGL-KO",
"mice",
"suggests",
"that",
"non-cardiac",
"tissues",
"such",
"as",
"adipose",
"tissue",
",",
"and",
"in",
"particular",
"ATGL-mediated",
"adipose",
"tissue",
"lipolysis",
",",
"participate",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"the",
"cardiac",
"lipidome",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism Variant",
"I-Organism Variant",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"B-Function",
"I-Function",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"role",
"of",
"ATGL",
"in",
"heart",
"failure",
"development",
"and",
"cardiac",
"metabolism",
"has",
"been",
"previously",
"studied",
",",
"with",
"most",
"studies",
"focusing",
"mainly",
"on",
"cardiac",
"ATGL",
"function",
"[",
"18β20",
"]",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-Protein",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"B-Protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"study",
",",
"we",
"concentrated",
"on",
"adipose",
"ATGL",
"and",
"the",
"impact",
"of",
"adipose",
"tissue",
"lipolysis",
"on",
"the",
"development",
"of",
"pressure-induced",
"LV",
"failure",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"B-Protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"B-Function",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O"
] |
[
"Whereas",
"previous",
"studies",
"demonstrated",
"that",
"perturbation",
"of",
"cardiac",
"ATGL",
"resulted",
"in",
"the",
"accumulation",
"of",
"TAG",
"and",
"impaired",
"systolic",
"LV",
"function",
"[",
"9",
",",
"18",
",",
"21",
"]",
",",
"we",
"showed",
"that",
"the",
"deletion",
"of",
"ATGL",
"in",
"adipose",
"tissue",
"prevents",
"pressure-induced",
"LV",
"failure",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"B-Protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Lipid",
"O",
"O",
"B-Function",
"I-Function",
"I-Function",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Protein",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"I-Disease",
"O"
] |
[
"This",
"finding",
"suggests",
"that",
"adipose",
"tissue",
"lipolysis",
"has",
"a",
"deleterious",
"effect",
"during",
"heart",
"failure",
"development",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"B-Function",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"are",
"in",
"accordance",
"with",
"the",
"positive",
"association",
"between",
"augmented",
"adipose",
"tissue",
"lipolysis",
"and",
"impairment",
"of",
"LV",
"function",
"in",
"heart",
"failure",
"[",
"5",
",",
"6",
"]",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"B-Function",
"O",
"O",
"O",
"B-Function",
"I-Function",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"relevance",
"of",
"adipose",
"tissue",
"lipolysis",
"in",
"heart",
"failure",
"development",
"has",
"recently",
"been",
"supported",
"by",
"a",
"study",
"in",
"mice",
"deficient",
"for",
"the",
"adipose-specific",
"perilipin-1",
"isoform",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"B-Function",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Organism",
"O",
"O",
"O",
"B-Protein",
"B-Protein",
"I-Protein",
"O"
] |
[
"Perilipin-1",
"has",
"been",
"shown",
"to",
"prevent",
"TAG",
"hydrolysis",
"in",
"adipocytes",
"[",
"22",
",",
"23",
"]",
"."
] |
[
"B-Protein",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Function",
"B-Lipid",
"I-Function",
"O",
"B-CellType",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"lack",
"of",
"perilipin-1",
"in",
"these",
"mice",
"resulted",
"in",
"enhanced",
"fat",
"tissue",
"lipolysis",
"associated",
"with",
"the",
"development",
"of",
"hypertrophic",
"cardiomyopathy",
"and",
"LV",
"failure",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-Protein",
"O",
"O",
"B-Organism",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"B-Function",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O"
] |
[
"Together",
",",
"these",
"data",
"support",
"a",
"role",
"for",
"adipose",
"tissue",
"lipolysis",
"in",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"LV",
"failure",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Function",
"I-Function",
"I-Function",
"O",
"O",
"B-Function",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O"
] |
[
"Communication",
"between",
"the",
"heart",
",",
"the",
"vasculature",
"and",
"other",
"organs",
"has",
"been",
"recently",
"described",
"as",
"an",
"important",
"pathophysiological",
"mechanism",
"involved",
"in",
"the",
"development",
"of",
"cardiovascular",
"disease",
"."
] |
[
"B-Function",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Function",
"I-Function",
"O",
"O",
"O",
"B-Function",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O"
] |
[
"Cross-talk",
"between",
"skeletal",
"muscle",
"β",
"heart",
",",
"or",
"between",
"kidney",
"β",
"heart/",
"vasculature",
"has",
"gained",
"increasing",
"attention",
"in",
"the",
"treatment",
"of",
"diseases",
"such",
"as",
"cardiac",
"cachexia",
"or",
"the",
"cardiorenal",
"syndrome",
"[",
"24",
",",
"25",
"]",
"."
] |
[
"B-Function",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Function",
"O",
"B-Disease",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O",
"B-Disease",
"I-Disease",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Adipose",
"tissue",
"communicates",
"with",
"multiple",
"organs",
"such",
"as",
"liver",
"and",
"skeletal",
"muscle",
",",
"or",
"as",
"described",
"in",
"this",
"study",
"with",
"the",
"heart",
"."
] |
[
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"B-Function",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O",
"B-Tissue",
"I-Tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-Tissue",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.